Ihren Ursprung hat die Abtei Nový Dvůr in der französischen Abtei Sept-Fons, wo nach der Samtenen Revolution die ersten Tschechen Mönche wurden. Es finden sich ebenfalls weiter zurückreichende Wurzeln, nämlich das zur Zeit der ersten Christen im Nahen Osten entstandene monastische Leben, die vom heiligen Benedikt verfasste Mönchsregel, die ersten Zisterzienserväter, die 1098 in Cîteaux das „Neue Kloster“ gründeten sowie die Klöster, die nach der Französischen Revolution aus der Abtei La Trappe hervorgegangen sind.

So stammen denn auch von einem einzigen Menschen, dessen Kraft bereits erstorben war, viele ab: zahlreich wie die Sterne am Himmel und der Sand am Meeresstrand, den man nicht zählen kann. Voll Glauben sind diese alle gestorben, ohne das Verheißene erlangt zu haben; nur von fern haben sie es geschaut und gegrüßt und haben bekannt, dass sie Fremde und Gäste auf Erden sind.“

(Brief an die Hebräer, 11,12-13)